Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Csn1s1P19228 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csn1s1P19228 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms