Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms