Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pou4f1P17208 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou4f1P17208 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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