Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmga1P17095 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms