Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms