Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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