Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdk1P11440 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms