Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PolP11369 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PolP11369 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolP11369 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms