Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PolP10400 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PolP10400 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PolP10400 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms