Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Schip1P0DPB4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Schip1P0DPB4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms