Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tmem254bP0DN90 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tmem254bP0DN90 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms