Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms