Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfrbP05622 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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