Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XlrP05531 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XlrP05531 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XlrP05531 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XlrP05531 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms