Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tgfb1P04202 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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