Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01810 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01810 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01810 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01810 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms