Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClppO88696 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClppO88696 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClppO88696 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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