Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CntfrO88507 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms