Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10509O88255 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm10509O88255 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm10509O88255 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm10509O88255 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm10509O88255 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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