Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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