Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrna4O70174 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms