Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cbx4O55187 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cbx4O55187 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cbx4O55187 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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