Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Syngr2O55101 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms