Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SlkO54988 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SlkO54988 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlkO54988 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlkO54988 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlkO54988 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SlkO54988 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlkO54988 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlkO54988 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SlkO54988 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms