Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffbO54788 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DffbO54788 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DffbO54788 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffbO54788 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffbO54788 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DffbO54788 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms