Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrxO54751 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrxO54751 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms