Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc4O35988 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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