Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms