Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg3O35902 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg3O35902 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms