Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cited2O35740 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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