Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lhx8O35652 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lhx8O35652 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lhx8O35652 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lhx8O35652 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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