Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TnxbO35452 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TnxbO35452 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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TnxbO35452 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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TnxbO35452 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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TnxbO35452 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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