Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atf6bO35451 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atf6bO35451 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms