Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xbp1O35426 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms