Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Slc18a3O35304 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms