Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1aO35134 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1aO35134 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms