Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LhbO09108 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LhbO09108 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LhbO09108 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms