Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcm2O09102 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gcm2O09102 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gcm2O09102 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcm2O09102 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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