Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MttpO08601 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MttpO08601 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MttpO08601 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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MttpO08601 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MttpO08601 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MttpO08601 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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