Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klf6O08584 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms