Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec22bO08547 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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