Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm8356J3QPD3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8356J3QPD3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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