Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5814J3QP80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms