Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc180J3QNE4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms