Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms