Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20825J3QM67 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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