Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c3J3QJW5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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