Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm17535J3KMR8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17535J3KMR8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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