Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nccrp1G3X9C2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms