Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Farp1F8VPU2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms